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類型分類:
科普知識(shí)
數(shù)據(jù)分類:
DCS系統(tǒng)

新概念:石墨單分子層孔道DNA測(cè)序法

發(fā)布日期:2022-04-17 點(diǎn)擊率:34

  美國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)與技術(shù)研究院(NIST)近期提出了一種高效、精確的DNA測(cè)序方法。通過(guò)將DNA分子從超薄的石墨片層結(jié)構(gòu)的孔洞中拉動(dòng),通過(guò)測(cè)量石墨孔洞邊緣產(chǎn)生的電位變化,從而實(shí)現(xiàn)高速、高精度、高效率的DNA測(cè)序。該方法不同于以前的桑格爾測(cè)序法以及第二代第三代測(cè)序法。相關(guān)工作發(fā)表在《Nanoscale》上。

  NIST的研究表明,該方法可以在一秒鐘時(shí)間內(nèi),識(shí)別約660億個(gè)堿基,而且有90%的準(zhǔn)確性,并且沒(méi)有假陽(yáng)性(falsepositive)。現(xiàn)在的這個(gè)測(cè)序還僅僅停留在概念層次,如果真的能夠被實(shí)驗(yàn)證明,該方法可能最終會(huì)比會(huì)常規(guī)DNA測(cè)序更快和更便宜,是真正面向未來(lái)的測(cè)序方法。

  在20世紀(jì)70年代開(kāi)發(fā)的常規(guī)測(cè)序,涉及分離、復(fù)制、打標(biāo)簽和DNA的重組件,來(lái)讀取的遺傳信息。NIST的新方法則基于將DNA拉過(guò)納米孔道的理論。這個(gè)概念開(kāi)創(chuàng)于20年前,基于帶電粒子(離子)通過(guò)納米通道,會(huì)引起電位的變化。時(shí)至今日,這個(gè)想法仍然很流行,但會(huì)造成諸如不必要的背景電流信號(hào)噪聲、或干擾,也面臨著選擇性不足的挑戰(zhàn)。

  相比之下,NIST的新測(cè)序流程,是要建立臨時(shí)的化學(xué)鍵,依靠石墨烯的能力,從打破這些化學(xué)鍵,將機(jī)械應(yīng)變信號(hào)轉(zhuǎn)變?yōu)殡娏餍盘?hào)。這實(shí)際上是一個(gè)很小的應(yīng)變傳感器,科學(xué)家認(rèn)為他們雖然沒(méi)有發(fā)明完整的技術(shù),但是提出了一個(gè)新的物理原則,即有可能是遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于其他測(cè)序方法。由于它的電性能和小型化的薄膜結(jié)構(gòu),石墨烯是在納米孔測(cè)序概念中非常合適。在新的NIST法,石墨烯納米帶(4.5X15.5納米)上有多個(gè)納米孔道(2.5納米寬),其中可以通過(guò)堿基。

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